初步设计分两个阶段，第一阶段2月28日前，主要完成建设任务的复核和初步设计大纲的编制。第二阶段根据部项目办审查通过的初步设计大纲要求完成初步设计报告。
一、二期工程初步设计分工 1、二期工程初步设计任务 水利部水利信息中心 负责二期工程整体初步设计和各流域机构、各省级单位初步设计报告的汇总工作，并编制以下报告，上报审查。
1）国家防汛抗旱指挥系统二期工程初步设计报告。
2）国家防汛抗旱指挥系统二期工程初步设计概算。
3）国家防汛抗旱指挥系统二期工程初步设计报告附件 （1）信息采集系统设计报告 （2）网络与安全系统设计报告 （3）应急移动指挥平台设计报告 （4）视频监控试点项目设计报告 （5）水情气象业务应用系统设计报告 （6）抗旱业务应用系统设计报告 （7）防洪调度和灾情评估系统设计报告 （8）综合信息服务系统设计报告 （9）综合数据库设计报告 （10）数据汇集与支撑平台设计报告 （11）系统集成设计报告 流域机构、各省级单位 负责二期可研中本流域机构、本省级单位建设任务的复核和细化，负责组织编制本流域机构、本省级单位的初步设计报告（其中应急移动指挥平台、网络与安全系统、综合数据库、数据汇集与支撑平台由水利部水利信息中心统一设计）。设计内容要全面，设计深度要达到招标的要求，并按照水利部的统一要求上报如下报告 XXX流域或省（自治区、直辖市）国家防汛抗旱指挥系统二期工程初步设计报告。
2、二期工程初步设计的经费 初步设计工作由各级项目办先行组织，设计经费根据各单位设计任务统一确定分配比例，待初步设计批复后按规定下达。
二、二期工程建设任务复核要求 初步设计工作组依据国家防汛抗旱指挥系统二期工程可行性研究报告，国家防汛抗旱指挥系统二期可研报告补充材料编制了详细的复核内容及要求，建设任务确认复核的具体内容及格式见附件（表1到表27），电子稿请在水利部网站下载，下载地址http//. 为了保证二期工程初步设计工作如期完成和上报审批，各级项目办必须严格按照质量和时间要求组织开展好本次建设任务复核工作。对于未按时间完成和质量达不到要求，使得建设内容无法确认的，责任自负。
在复核中要注意以下事项 1、考虑各地区、各单位的实际情况，水情分中心、工情分中心的建设内容在保证满足二期工程可研报告中设计要求的前提下，允许在预算的等额（45万元）范围内进行优化调整。水情分中心、工情分中心如有调整或增加请详细说明理由。
2、中央报汛站改造的建设内容，要按照二期工程可研报告中设计要求，结合各站的实际情况落实建设的具体内容，但不能调整为流量监测项目（仅限于雨量和水位监测项目）。
3、请各项目办进一步组织落实104个工程视频监控试点的建设内容，建设与运行管理单位。
4、由于墒情监测站的建设基本属于新设站点，根据水文条例，新建的墒情监测站应由各省按照水利部颁布的土壤墒情监测规范，统一规划，统一组织建设和运行管理。
5、关于网络与安全、应急通信系统的建设内容由部水利信息中心统一设计，请各流域机构、各省级单位如实填报相关的情况，避免不必要的重复建设。
6、关于洪水预报和防洪调度系统的建设，目前的设计是基于一期工程的建设成果，扩充断面的预报方案和扩展防洪调度区段，并扩充完善系统功能，各流域机构项目办应进一步核实目前系统的实际应用情况，核实预报断面，核实调度区段，提出新的功能需求。
7、气象业务应用系统建设的主要内容是雷达信息的接收和应用，各流域机构将建立与中国气象局下设的流域气象中心的宽带网络连接，请各流域机构进一步了解确认连接的条件和接受信息的种类，并提出具体方案。
8、抗旱业务应用和灾情评估系统的建设，目前使用的成功案例和经验较少，请各流域机构和各省级单位提出业务工作的详细需求，如有成功案例请注明。
9、为了保证一期工程建设成果的继承，综合数据库建设继续采用一期工程设计的体系结构，请各流域机构和各省级单位项目办提交各类数据库建设情况，特别是工程数据库的建设与使用的实际情况，包括各类工程数据的实际入库情况。
10、二期工程是一期工程的建设范围和内容扩展，省级以上软硬件环境在一期工程中已经基本建设完成，因此在二期工程中原则上没有此项建设任务，如有需求，各单位应根据实际情况自行解决。
11、目前国家防总正在组织实施山洪灾害系统建设，建设成果如何整合到国家防汛抗旱指挥系统中，各地有什么经验和建议。
12、其它问题和建议请另加说明，并尽可能详细、具体。
三、初步设计编制要求 根据国家发改委批复的国家防汛抗旱指挥系统二期工程可行性研究报告的建设内容和进一步开展需求调研的实际情况，按照国家发展和改革委员会2007年55令中关于国家电子政务工程建设项目初步设计方案和投资概算报告编制要求，初步设计的主要任务是在国家防汛抗旱指挥系统二期工程可行性研究报告的基础上，进一步明确二期工程的建设目标，建设范围、建设任务、建设内容、建设方案；
进一步确定各项建设内容、建设方案的技术细节；
进一步明确各单项工程的划分和组织实施的方式；
进一步细化并确定二期工程的经费概算、经费筹措方案，以及年度投资比例；
进一步确定二期工程的项目建设管理方式，并明确分工责任。进一步确定二期工程建设的周期和年度实施计划。
按照国家电子政务工程建设项目初步设计方案和投资概算报告编制要求，初步确定国家防汛抗旱指挥系统二期工程初步设计报告编制的格式和提纲要求如下 第一章 项目概述 1、项目名称建设项目的全称及简称，应与项目可行性研究报告名称一致。
2、项目建设单位及负责人，项目责任人项目建设单位含参建单位及实施机构名称，项目建设单位负责人及项目责任人姓名和职务。
3、初设及概算编制单位初步设计报告编制单位名称及设计资质如有多家单位应全部列出，并附资质复印件。
4、初设和概算编制依据列举所依据的重要法律法规，文件，引用的国家标准和行业标准等名称及具体引用条款内容，如中央和国务院的有关文件精神，国家电子政务工程建设规划，项目审批部门对项目建议书和可研报告的批复，项目需求分析报告及项目审批部门组织专家对需求分析报告提出的评议意见等，并将其中必要的部分全文附后，作为报告的附件。
5、项目建设目标，规模，内容，建设期简要概括项目主要建设目标，建设规模，建设内容和建设计划工期。
6、总投资及资金来源引述概算总投资及其构成，资金来源。
7、效益及风险引述项目建成后的社会及经济效益指标，项目建设期及建成后可能的风险。
8、相对可研报告批复的调整情况引述初步设计方案相对项目审批部门对可研报告批复进行变更调整主要内容的结果。
9、主要结论与建议对项目初步设计质量进行简单评价以及为使项目顺利建设需要落实或补充的环境条件等建议。
第二章 项目建设单位概况 1、项目建设单位与职能依据有关文件规定摘录与项目有关 职能的全部条款。
2、项目实施机构与职责介绍实施机构与项目建设单位的关系，及其有效职责范围。
第三章 需求分析 1、需求分析结论如果与可研报告一致可以直接引述，如果有变化，对变化部分论述变化内容及其理由。
2、系统功能指标列出量化指标。
3、信息量指标列出量化指标。
4、系统性能指标列出量化指标。
并需明确项目建设的时空边界。
第四章 设计方案 1、建设目标，规模与内容全面描述本期工程的建设目标规模和各项建设内容。
2、标准规范建设内容描述将制定的每个标准规范名称及主要编写内容。
3、信息采集系统设计 1）水情信息采集系统设计描述每个水情分中心的具体建设内容，技术指标，确定每个水文监测站改造的具体内容及信息传输方式。
2）工情信息采集系统设计描述每个工情分中心的具体建设内容，技术指标，确定每个工情分中心配备的移动信息采集设备的技术指标要求，设计各类工情信息的传输方式。
3）旱情信息采集系统设计描述每个地市级单位和县级单位旱情信息报表的填报内容及格式，确定旱情信息报表的报送及汇集方式。确定每个墒情监测站的建设管理的水文单位（水情分中心或省水情中心，确定每个墒情监测站的具体位置和类型（固定监测站或移动监测站），设计各类墒情信息的传输方式。
4、信息资源规划和数据库设计 数据库设计沿用一期工程相关的设计成果，重点进行旱情数据库设计。
5、数据汇集平台设计扩展数据汇集种类和功能，扩大汇集平台的应用范围。
6、应用支撑平台设计扩展应用支撑平台的功能，配置并开发相应的中间件产品。
7、业务应用系统设计 1）水情业务应用系统设计 设计并完善水情业务系统的功能，增加洪水预报断面方案，设计系统的业务流程。
2）气象业务应用系统设计设计并完善气象业务系统的功能，增加气象雷达的监测数据及相应的数据产品，设计系统的业务流程。
3）抗旱业务应用系统设计结合遥感技术的应用和地面监测数据、统计数据收集，设计并完善抗旱业务系统的功能，设计系统的业务流程。
4）防洪调度应用系统设计扩展水利部、各流域机构的洪水调度区域或区间，设计并完善防洪调度应用系统的功能，设计系统的业务流程。
5）灾情评估系统设计收集各级统计部门的社会经济统计数据，利用地理信息系统技术，设计灾情评估系统的功能，设计系统的业务流程。
6）综合信息服务系统设计利用门户技术，结合综合数据库的建设，设计集各类信息于一体的综合信息服务系统，设计各类信息产品的自动生成模式和功能模块，设计各类信息的综合展示方式。
8、存储系统设计分析存储系统的数据量级和提供服务的响应性能，进行存储系统的扩展设计。
9、网络系统设计分析目前水利系统的网络应用需求，结合新的技术等进行网络的扩展设计。
10、安全系统设计按照国家关于信息系统安全等的建设的要求，结合各级安全系统建设的实际情况，进行各级安全系统的设计。
11、备份系统设计进行灾备系统的地点确定，并结合当地网络、存储系统的实际情况，进行备份系统的功能和量级设计，进行系统的备份模式和恢复模式设计。
12、系统集成设计进行各种资源的整合设计，进行各级系统的连接与共享设计。
13、系统配置及软硬件选型原则描述二期工程中设备配置和软件配置的基本原则，描述相应设备和软件的选择理由。
14、系统软硬件配置清单。
15、系统软硬件物理部署方案。
16、会商环境配套工程设计。
17、环保，消防，职业安全卫生和节能措施的设计。
18、初步设计方案相对可研报告批复变更调整情况的详细说明。
19、标准规范建设内容 以上各项建设内容是在批复的可行性研究报告中所确定的技术方案基础上进一步细化和量化，其各自边界要明确，内在逻辑联系清晰，要具体体现设计原则和明显体现利用现有资源的内容。
第五章 项目建设与运行管理 1、管理机构指针对项目建设过程中的项目法人和管理机构详细方案。
2、项目实施机构指直接进行项目建设机构详细组织结构，职责，管理制度等。
3、运行维护机构运行维护主体的比选及其确定。
4、核准的项目招标方案若与可研批复相比没有变化，可直接引述;若有变化，则需要说明变化内容及其理由